More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3213 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  100 
 
 
340 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  100 
 
 
340 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
340 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  77.58 
 
 
349 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  76.97 
 
 
349 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  76.67 
 
 
349 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  37.62 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  36.99 
 
 
344 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4580  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  39.72 
 
 
358 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  32.47 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  34.1 
 
 
342 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  33.55 
 
 
341 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.86 
 
 
333 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.76 
 
 
336 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  32.52 
 
 
341 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  31.76 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  31.76 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  31.13 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  31.76 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  32.66 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  33.75 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.25 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  32.79 
 
 
343 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  31.15 
 
 
337 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  31.01 
 
 
352 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.17 
 
 
327 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  33.01 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  33.79 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  31.89 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  31.23 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  32.34 
 
 
325 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  32.37 
 
 
327 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  32.37 
 
 
327 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  29.87 
 
 
337 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  32.98 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  34.09 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.46 
 
 
349 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  25.64 
 
 
321 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  28.53 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  36.04 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  30.51 
 
 
338 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  32.01 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  32.67 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  33.68 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  30.85 
 
 
341 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  30.17 
 
 
338 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.39 
 
 
318 aa  109  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  30.17 
 
 
338 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.19 
 
 
348 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  30.41 
 
 
350 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  31.54 
 
 
349 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  31.54 
 
 
349 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
339 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.6 
 
 
339 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.01 
 
 
320 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.28 
 
 
352 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  29.39 
 
 
350 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.1 
 
 
349 aa  102  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.53 
 
 
337 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.84 
 
 
360 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.89 
 
 
351 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.83 
 
 
334 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  31.52 
 
 
329 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  29.74 
 
 
349 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.21 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.72 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.83 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  28.86 
 
 
372 aa  96.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  29.28 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  26.38 
 
 
348 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  29.28 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.8 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  30.3 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  28.06 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  27.97 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  29.28 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  27.76 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  31.89 
 
 
372 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
346 aa  92.8  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.36 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  30.21 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.16 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  29.17 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  25.93 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  27.24 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  25.93 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  25.93 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  27.74 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.47 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.47 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  32.03 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.62 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
347 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  31.85 
 
 
345 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  30.63 
 
 
341 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  30.92 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>