More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0842 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  100 
 
 
321 aa  660    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.34 
 
 
334 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  32.88 
 
 
335 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.15 
 
 
333 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 
332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  29.32 
 
 
326 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  30.5 
 
 
327 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  28.82 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.05 
 
 
327 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  28.36 
 
 
345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  29.62 
 
 
343 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  26.9 
 
 
355 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  27.46 
 
 
346 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.19 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  26.5 
 
 
349 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
346 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  27.19 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  26.84 
 
 
359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  27.1 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.25 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  24.93 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.96 
 
 
352 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  25.36 
 
 
327 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  27.27 
 
 
349 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  27.27 
 
 
349 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  25.59 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  27.21 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  26.9 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  26.96 
 
 
349 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  24.92 
 
 
350 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
347 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  25.73 
 
 
351 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.08 
 
 
361 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  24.29 
 
 
350 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  26.76 
 
 
341 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
345 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  27.76 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  24.61 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  26.51 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  25.18 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  25.9 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  25.91 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  24.84 
 
 
372 aa  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  25.91 
 
 
343 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  25.91 
 
 
343 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.67 
 
 
328 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  25.58 
 
 
352 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  27.5 
 
 
344 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  24.15 
 
 
354 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  26.74 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.27 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.11 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  25.42 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  25.64 
 
 
340 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  25.64 
 
 
340 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.64 
 
 
340 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  26.22 
 
 
341 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.04 
 
 
333 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.36 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  23.92 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  26.39 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  26.39 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.53 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  26.85 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  25.86 
 
 
349 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.46 
 
 
349 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.79 
 
 
335 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.03 
 
 
298 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  27.34 
 
 
360 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.1 
 
 
328 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  22.46 
 
 
330 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.29 
 
 
328 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  26.18 
 
 
321 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26 
 
 
318 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  22.88 
 
 
361 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.1 
 
 
327 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  25.87 
 
 
311 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.01 
 
 
323 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  24.39 
 
 
357 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  24.93 
 
 
346 aa  99.4  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  25.23 
 
 
368 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.56 
 
 
345 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.07 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  24.88 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  24.6 
 
 
341 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  24.92 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  25.17 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.68 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  21.8 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  24.35 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  23.05 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  23.05 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  23.05 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  21.94 
 
 
372 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>