More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1630 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 333 aa  668    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  60.37 
 
 		 345 aa  435  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.97 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.12 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.77 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.09 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  34.11 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.19 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.12 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.97 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.04 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  31.58 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.86 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.81 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.79 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.43 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  33.57 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.81 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.81 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.84 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.8 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.96 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  33.98 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.63 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  31.61 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.4 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.33 
 
 		 335 aa  99.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.44 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.61 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.07 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.63 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  30.82 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.62 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  35.24 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  34.13 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.49 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  39.51 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  30.79 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  29.17 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  27.79 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 346 aa  95.9  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  29.17 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  29.17 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.51 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  27.79 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  28.53 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  29.17 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.96 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  40.66 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.22 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  30.63 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  33.75 
 
 		 350 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.49 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.38 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  27.84 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  27.49 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  31.42 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  31.95 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  27.49 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  27.49 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.9 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.97 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.97 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.97 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  30.32 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  27.19 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  28.53 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  30.42 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  29.56 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  26.28 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  33.19 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  32.74 
 
 		 350 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.45 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  26.55 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  29.38 
 
 		 349 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.51 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3798  Luciferase-like monooxygenase  36.41 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.535605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.33 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  32.57 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  32.91 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.13 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  30.27 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2621  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.88 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.36 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  32.11 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  30.67 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  26.52 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  29.95 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  29.68 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  32.49 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  26.62 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  25.64 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  32.37 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>