More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0724 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
336 aa  681    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.59 
 
 
334 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.37 
 
 
318 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.02 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.4 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.4 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.31 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.03 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.79 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.91 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
328 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.61 
 
 
320 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.61 
 
 
320 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.06 
 
 
326 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.17 
 
 
328 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.02 
 
 
328 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.15 
 
 
327 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.03 
 
 
337 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.84 
 
 
327 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.94 
 
 
349 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.86 
 
 
333 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  29.45 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  28.72 
 
 
317 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.09 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  27.99 
 
 
336 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.93 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  27.13 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.22 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  27.7 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  27.7 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  27.7 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.87 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  26.25 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.94 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  21.69 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  24.31 
 
 
383 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  28.21 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  26.84 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  26.84 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.84 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  26.76 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  25.44 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  25.97 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.97 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  27.6 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.94 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.8 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  24.01 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  29.11 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  26.99 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  29.3 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.34 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  28.85 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  25.86 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  22.22 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  24.05 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  26.35 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  27.4 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.09 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.25 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  25.83 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  28.07 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  25.08 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  25.67 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  25.79 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  25.08 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.35 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.61 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  26.67 
 
 
307 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  26.51 
 
 
372 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  29.34 
 
 
339 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  32.47 
 
 
299 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  23.58 
 
 
382 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.07 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  23.42 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  26.65 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  24.64 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  35.11 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.44 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  22.32 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.79 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  23.08 
 
 
330 aa  59.7  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  29.24 
 
 
323 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  24.92 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  25.39 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.25 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  22.74 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  28.45 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  29.49 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  28.42 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.9 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  25.68 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.42 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  24.55 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.05 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  25.38 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>