More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0223 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
341 aa  701    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  68.29 
 
 
330 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  61.74 
 
 
353 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  63.1 
 
 
336 aa  434  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  61.49 
 
 
363 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  60 
 
 
343 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  61.54 
 
 
383 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  60.88 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  47.45 
 
 
333 aa  309  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.02 
 
 
333 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  43.24 
 
 
333 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.51 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.6 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.03 
 
 
320 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.48 
 
 
345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.7 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.35 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.79 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.85 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.85 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.87 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.19 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.63 
 
 
326 aa  89.7  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.57 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.68 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  24.69 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.7 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.41 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  28.12 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.95 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  24.38 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.69 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  33.33 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.74 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  31.58 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.64 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  26.09 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  29.35 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  29.35 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  29.35 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.5 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.7 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.05 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.88 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  29 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  24.55 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  27.4 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  29.21 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  24.78 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  29.95 
 
 
299 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  24.56 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  23.81 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.55 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  25.51 
 
 
333 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  28.28 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.95 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.3 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4778  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.41 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  28.57 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  31.05 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  27.62 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  28.96 
 
 
344 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  26.85 
 
 
326 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  30.05 
 
 
372 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.66 
 
 
301 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  31.46 
 
 
322 aa  62.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.24 
 
 
344 aa  62.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  22.64 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  29.11 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  24.31 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  29.66 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  27.45 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.18 
 
 
313 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  30.64 
 
 
557 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  24.02 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  29.69 
 
 
484 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  25.54 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
754 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  22.87 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  24.42 
 
 
359 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  30.41 
 
 
381 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4813  alkanesulfonate monooxygenase  28.43 
 
 
364 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  30.57 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.24 
 
 
314 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  25.93 
 
 
325 aa  59.3  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  29.46 
 
 
543 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.17 
 
 
296 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  26.88 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.57 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  25.93 
 
 
327 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  25.96 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  32.72 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  26.59 
 
 
753 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  22.85 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  26.21 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>