More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1840 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  99.71 
 
 
347 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  90 
 
 
348 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  100 
 
 
348 aa  714    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  99.71 
 
 
348 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  89.15 
 
 
347 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  57.94 
 
 
359 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  47.8 
 
 
364 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  39.46 
 
 
347 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.49 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.17 
 
 
328 aa  86.3  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.22 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.56 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  32.43 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.72 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  32.3 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.72 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  34.87 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  32.35 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.56 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.08 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.12 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  30.16 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.35 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.19 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.19 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.19 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  30.32 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.02 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.63 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  30.89 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  24.92 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  24.43 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  24.92 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  24.92 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.28 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.74 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  30.68 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  23.86 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.35 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.53 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  31.14 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  26.35 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  27.15 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  26.33 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  32.93 
 
 
301 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
344 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.23 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.66 
 
 
325 aa  62.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  30.29 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  30.73 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.01 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
754 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  26.88 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  26.79 
 
 
341 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 
306 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  27.63 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  27.6 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  23.31 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  23.31 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  25.93 
 
 
344 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  23.31 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.24 
 
 
349 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  31.14 
 
 
391 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  31.14 
 
 
391 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  24.26 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  26.98 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.63 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  26.24 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  25.35 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.34 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  30.41 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  30.54 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  30.43 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  27.05 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  37.04 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  27.51 
 
 
389 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  23.55 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  27.85 
 
 
293 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  28.43 
 
 
345 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
293 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  25 
 
 
345 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  27.17 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  37.04 
 
 
320 aa  56.2  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.2 
 
 
346 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  25 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  26.64 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  27.33 
 
 
764 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  27.43 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  25 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.5 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  24.9 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  43.24 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.65 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>