More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1399 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  100 
 
 
293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  86.69 
 
 
297 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  39.32 
 
 
310 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  40.48 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  38.98 
 
 
302 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.41 
 
 
296 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  40.07 
 
 
295 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  38.59 
 
 
303 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  38.49 
 
 
283 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2897  Luciferase-like, subgroup  42.86 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  39.86 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0085  luciferase family protein  39.12 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  32.97 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  32.04 
 
 
306 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0961  luciferase family protein  44.02 
 
 
284 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0055075  decreased coverage  0.00468194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  31.37 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  29.64 
 
 
282 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  35.09 
 
 
307 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  29.37 
 
 
290 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  30.51 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  32.05 
 
 
287 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  30.85 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  30.85 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  32.19 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  30.09 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  30.09 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  30.09 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
309 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  30.04 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  30.52 
 
 
343 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  26.74 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.07 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  26.05 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  26.89 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  33.73 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  29.05 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  30.25 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  28.63 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  27.97 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  28.63 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.59 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  30.87 
 
 
305 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  37.14 
 
 
336 aa  79  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  32.95 
 
 
325 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.64 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  30.73 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  25.69 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.67 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  30.49 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  26.04 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  32.02 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  32.02 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  29.57 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  34.52 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  26.39 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.96 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  31.51 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  29.41 
 
 
353 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.51 
 
 
328 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  29.51 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  30 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.28 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  38.97 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  32.02 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  34.68 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  30.83 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.56 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  30.51 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  32.59 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.61 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  35.39 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  30.46 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  31.16 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.19 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.05 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  28.04 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  30.25 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  30.17 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  30.68 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  34.01 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  28.11 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  31.5 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  28.81 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  32 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  30.81 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  31.28 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  30.42 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  28.05 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  30.96 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  30.68 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  25.82 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>