More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  59.03 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  55.83 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  55.9 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  51.74 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0085  luciferase family protein  55.12 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  52.88 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2897  Luciferase-like, subgroup  52.22 
 
 		 301 aa  261  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  51.24 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  46.58 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  42 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  40.41 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0961  luciferase family protein  47.04 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0055075  decreased coverage  0.00468194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.34 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  33.22 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  31.47 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  35.23 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  34.75 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  33.67 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  33.08 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  33.33 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  33.33 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  32.84 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  30.13 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  30.18 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  33.33 
 
 		 368 aa  92.8  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  38.27 
 
 		 311 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  31.92 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  33.22 
 
 		 316 aa  89.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.29 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  35.2 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  29.26 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  27.37 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  32.14 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  33.15 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  34.74 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  31.56 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  38.84 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  27.82 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  31.91 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  30.88 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  32.92 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  32.74 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.8 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  34.33 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  31.88 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  33.13 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  32.87 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.09 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  38.1 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  38.1 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  28.65 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  35.33 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  28.03 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  38.1 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  31.72 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  34.13 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  35.59 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  28.81 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.21 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  28.65 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  34.48 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3462  Luciferase-like, subgroup  36.48 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.92 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.75 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.23 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  34.02 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  28.39 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  27.9 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  31.63 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.12 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  35 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  31.55 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  32.76 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  29.01 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.74 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  33.97 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.14 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.82 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  29.38 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.82 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.82 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  33.18 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.82 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  31.49 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  30.52 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  29.24 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  33.49 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  29.02 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>