More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3284 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  53.26 
 
 
302 aa  295  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  50.17 
 
 
310 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  52.43 
 
 
296 aa  275  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.3 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2897  Luciferase-like, subgroup  52.54 
 
 
301 aa  265  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0085  luciferase family protein  51.39 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  47.47 
 
 
293 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  44.91 
 
 
283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  43.54 
 
 
297 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  40.07 
 
 
293 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7696  Luciferase-like monooxygenase  37.92 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0961  luciferase family protein  46.34 
 
 
284 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0055075  decreased coverage  0.00468194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  33.09 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.14 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  31.45 
 
 
287 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  29.15 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.3 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 
281 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  29.01 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  28.57 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  31.56 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  31.42 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  28.81 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  34.22 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  29.13 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  28.47 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  28.47 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  32.64 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  31.96 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  33.61 
 
 
764 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  29.53 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  34.36 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  31.71 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  29.74 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  26.74 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.43 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  28.89 
 
 
337 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  31.29 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  27.57 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  30.28 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  27.57 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  30.28 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  27.57 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  30.28 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  31.82 
 
 
753 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.58 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  32.13 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  29.92 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
754 aa  73.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  35.61 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  32.26 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  28.76 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  23.47 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  30.33 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  33.7 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.5 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.12 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  27.69 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  36.07 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  30.42 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  31.11 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  32.33 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  29.8 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.46 
 
 
507 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.38 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  30 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  36.87 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
557 aa  68.9  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  28.18 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.1 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  34.94 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  33.33 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.24 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.54 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  32.43 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  27.24 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  30.14 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.23 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  30.24 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  29.57 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  26.86 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  27.4 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  27.4 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  29.56 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  30.73 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  32.77 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4930  luciferase-like protein  31.39 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  29 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  31.44 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  31.39 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>