More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
507 aa  1018    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  62.43 
 
 
543 aa  630  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  61.41 
 
 
557 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  53.1 
 
 
531 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  66.55 
 
 
300 aa  359  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  66.21 
 
 
754 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  61.33 
 
 
758 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  61.92 
 
 
753 aa  350  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  62.88 
 
 
299 aa  349  8e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  61.67 
 
 
764 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.26 
 
 
299 aa  334  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  43.24 
 
 
519 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  58.84 
 
 
298 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  56.71 
 
 
308 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  53.85 
 
 
775 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  51.95 
 
 
293 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  44.44 
 
 
752 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  39.34 
 
 
306 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.18 
 
 
301 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3153  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.6 
 
 
303 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0290174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6599  hypothetical protein  34.67 
 
 
316 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8878  hypothetical protein  33.22 
 
 
303 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.96 
 
 
726 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.51 
 
 
734 aa  113  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.14 
 
 
282 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.81 
 
 
203 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  37.99 
 
 
288 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 
287 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.03 
 
 
265 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
343 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.32 
 
 
328 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  39.69 
 
 
371 aa  94  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  32.77 
 
 
299 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.32 
 
 
328 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2295  sugar transporter superfamily protein  28.95 
 
 
251 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.467555  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  32.02 
 
 
315 aa  90.5  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.31 
 
 
287 aa  90.5  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  30.14 
 
 
310 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  32.82 
 
 
288 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.8 
 
 
292 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  32.03 
 
 
336 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  30.11 
 
 
281 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  35.24 
 
 
372 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  29.44 
 
 
300 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  31.76 
 
 
336 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  27.88 
 
 
316 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  32.24 
 
 
290 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2239  oxidoreductase  28.74 
 
 
264 aa  87  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317079  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
328 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.58 
 
 
299 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  28.05 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  31.46 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  31.75 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  31.46 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  32.42 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  30.59 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  32.9 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  32.11 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.79 
 
 
262 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2683  luciferase family protein  29.67 
 
 
298 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0596909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  34.24 
 
 
272 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.83 
 
 
339 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.03 
 
 
289 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  30.59 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  30.59 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  31.15 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  36.14 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  35.96 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  30.59 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.71 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  35.24 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  35.24 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  34.83 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  34.63 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  34.63 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  28.7 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  30.98 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  34.76 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  34.63 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.04 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.8 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  32.09 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.88 
 
 
346 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  26.9 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  29.52 
 
 
306 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  28.97 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  28.25 
 
 
306 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
309 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  33.19 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.26 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  31.63 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5381  hypothetical protein  28.52 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  28.9 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  29.87 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5470  hypothetical protein  28.52 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.229318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5757  hypothetical protein  28.52 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.631627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>