More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8878 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8878  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  63.67 
 
 
301 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3153  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  63.79 
 
 
303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0290174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6599  hypothetical protein  58.53 
 
 
316 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  38.49 
 
 
519 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  39.13 
 
 
754 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  39.13 
 
 
299 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.35 
 
 
299 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  34.22 
 
 
308 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  36.45 
 
 
764 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  36.09 
 
 
298 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
758 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  36.72 
 
 
543 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  36.97 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
531 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  36.33 
 
 
753 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
557 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.22 
 
 
507 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  34.74 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 
775 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  30.36 
 
 
752 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  34.41 
 
 
372 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  34.41 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  34.41 
 
 
391 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  34.41 
 
 
391 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  33.68 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  25.83 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  31.6 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  31.43 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  29.66 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.1 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  31.4 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.87 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  28.21 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  28.23 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  29.94 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.18 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  27.23 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  27.36 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  31.53 
 
 
353 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.94 
 
 
345 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  28.88 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  29.38 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
343 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.23 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  29.02 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  31.05 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.77 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  31.43 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.23 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  33.33 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  28.71 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  25.75 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  25.75 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  25.75 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  31.43 
 
 
328 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
336 aa  62.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  29.89 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  30.41 
 
 
389 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  23.79 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  26.8 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  30.14 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  29.17 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  25.9 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  28.04 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  28.5 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  30.23 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  30.49 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  25.7 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30460  putative flavin-dependent oxidoreductase  33.11 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  28.64 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  29.47 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  31.02 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  27.51 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  29.69 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  26.5 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  24.15 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  28.72 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  28.17 
 
 
290 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  30.32 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  29.33 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  30.32 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  28.96 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  29.49 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.79 
 
 
292 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.84 
 
 
326 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  32.14 
 
 
308 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  27.13 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  29.13 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  30.11 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.38 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.13 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.81 
 
 
362 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5235  alkanesulfonate monooxygenase  30.25 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  28.87 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>