More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6599 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6599  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  618  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3153  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  69.57 
 
 
303 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0290174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  60.47 
 
 
301 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8878  hypothetical protein  58.53 
 
 
303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  37 
 
 
519 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.1 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 
543 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  38.24 
 
 
764 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  40.51 
 
 
754 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  35.29 
 
 
308 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  38.16 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  38.69 
 
 
753 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  37.16 
 
 
298 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  36.93 
 
 
557 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
531 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
758 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.67 
 
 
507 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  33.99 
 
 
300 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  35.55 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  34.54 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  32.21 
 
 
775 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  31.49 
 
 
752 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  34.74 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  30.93 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.86 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  31.96 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  31.96 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  31.96 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  26.52 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  31.91 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  26.16 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  25.91 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  33.9 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  25.68 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2800  luciferase-like protein  25.93 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2844  luciferase family protein  25.93 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  32.94 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  27.6 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2827  luciferase family protein  25.93 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.543499  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  27.8 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  26.56 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  28.83 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.71 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  30.98 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  33.95 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.44 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  32.79 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  32.77 
 
 
389 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  31.82 
 
 
360 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3347  luciferase family protein  27.24 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.31131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  29.69 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  29.95 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  29.44 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  29.44 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.35 
 
 
305 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.67 
 
 
734 aa  62.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  28.27 
 
 
342 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.31 
 
 
339 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  30.71 
 
 
350 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.92 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.06 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  33.33 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  28.98 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0331  Luciferase-like monooxygenase  27.34 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  29.52 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.72 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  25.74 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  27.98 
 
 
313 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  26.87 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  27.98 
 
 
313 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.81 
 
 
332 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.86 
 
 
331 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.31 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  26.01 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  29.25 
 
 
289 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  35.04 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  31.34 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.31 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.14 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  27.57 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  29.08 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  30.61 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  26.19 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.96 
 
 
726 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  30.61 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  24.87 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  32.69 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  28.21 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  30.91 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  30.61 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  25.87 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  30.05 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  28.63 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>