More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1301 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 
336 aa  685    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 
328 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  32.94 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.58 
 
 
346 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.73 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 
364 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  29.88 
 
 
334 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  27.55 
 
 
328 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.66 
 
 
342 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.29 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  26.67 
 
 
353 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.77 
 
 
294 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.66 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  29.17 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  33.51 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  31.25 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.38 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 
374 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  27.02 
 
 
343 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  32.33 
 
 
290 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.35 
 
 
352 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
328 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  29 
 
 
734 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 
334 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  31.1 
 
 
323 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  29.79 
 
 
315 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  29.87 
 
 
308 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  29.87 
 
 
308 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.85 
 
 
331 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  32.91 
 
 
307 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  29.87 
 
 
308 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.54 
 
 
365 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 
377 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.3 
 
 
328 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  28.53 
 
 
310 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  28.63 
 
 
285 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.4 
 
 
364 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.79 
 
 
365 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  25.85 
 
 
354 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  34.98 
 
 
308 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.67 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  32.93 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  31.98 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  26.98 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 
336 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.26 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  29.54 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  25.07 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  32.72 
 
 
322 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  25.71 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  28.69 
 
 
338 aa  95.9  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  32.81 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  32.93 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  33.33 
 
 
308 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.04 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  32.42 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  26.76 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  33.12 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  32.42 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
281 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  24.79 
 
 
330 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  27.78 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  30.53 
 
 
278 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  27.16 
 
 
348 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  29.23 
 
 
336 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  32.51 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  23.55 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  32.66 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  23.55 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  23.55 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  25.21 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  31.36 
 
 
306 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 
288 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.95 
 
 
299 aa  92.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  28.74 
 
 
354 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  25 
 
 
383 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  34.53 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  25.21 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  27.54 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  26.74 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  31.68 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.19 
 
 
288 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.12 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
282 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  24.37 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  32.16 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.97 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  32.08 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.28 
 
 
436 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  24.23 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.28 
 
 
436 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.28 
 
 
436 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  27.36 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  30.77 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  26.18 
 
 
358 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>