More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3087 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  52.69 
 
 		 753 aa  684    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  52.37 
 
 		 764 aa  652    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  51.84 
 
 		 758 aa  663    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 752 aa  1442    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  54.62 
 
 		 734 aa  677    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  51.84 
 
 		 754 aa  635  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.32 
 
 		 726 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  40.79 
 
 		 775 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  52.84 
 
 		 299 aa  243  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  47.64 
 
 		 298 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  47.81 
 
 		 543 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  40.05 
 
 		 446 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  46.23 
 
 		 557 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 		 447 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.48 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.6 
 
 		 299 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  47.1 
 
 		 300 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.44 
 
 		 507 aa  200  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  33.41 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  41.3 
 
 		 308 aa  195  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  33.68 
 
 		 479 aa  190  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  32.46 
 
 		 461 aa  187  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  31.98 
 
 		 479 aa  184  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.04 
 
 		 464 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 		 479 aa  179  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  30.57 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  33.62 
 
 		 463 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.24 
 
 		 461 aa  174  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  33.4 
 
 		 499 aa  173  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.72 
 
 		 473 aa  173  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  35.64 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  33.84 
 
 		 461 aa  171  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 531 aa  170  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  39.46 
 
 		 519 aa  170  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  31.13 
 
 		 458 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  33.12 
 
 		 478 aa  167  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  30.15 
 
 		 462 aa  165  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  33.19 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  29.76 
 
 		 462 aa  161  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.66 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  31.53 
 
 		 459 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 		 461 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  35.43 
 
 		 465 aa  158  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 478 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  31.13 
 
 		 473 aa  156  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  34.42 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  34.3 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  32.9 
 
 		 456 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  32.9 
 
 		 461 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  32.46 
 
 		 465 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.33 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  32.1 
 
 		 477 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.44 
 
 		 472 aa  151  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.81 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  32.29 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.57 
 
 		 460 aa  149  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  35.43 
 
 		 450 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.62 
 
 		 469 aa  148  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  31.89 
 
 		 456 aa  147  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  43.15 
 
 		 468 aa  144  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  32.42 
 
 		 467 aa  144  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  31.05 
 
 		 466 aa  144  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  32.1 
 
 		 477 aa  144  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.64 
 
 		 462 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  32.75 
 
 		 487 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  32.47 
 
 		 465 aa  140  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 466 aa  140  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  31.26 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  32.68 
 
 		 465 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 444 aa  139  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  32.09 
 
 		 449 aa  138  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  29.74 
 
 		 456 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  28.88 
 
 		 473 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  31.43 
 
 		 596 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 		 474 aa  137  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.5 
 
 		 481 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.76 
 
 		 466 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  35.45 
 
 		 306 aa  135  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.79 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  31.41 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  29.02 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.79 
 
 		 444 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  32.97 
 
 		 458 aa  130  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30.32 
 
 		 462 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 462 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  31.28 
 
 		 470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 293 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.38 
 
 		 462 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  31.11 
 
 		 459 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  31.53 
 
 		 470 aa  121  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  31.43 
 
 		 461 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 		 502 aa  120  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 		 495 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.18 
 
 		 473 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  30.54 
 
 		 465 aa  119  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.2 
 
 		 490 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  29.13 
 
 		 474 aa  117  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  43.5 
 
 		 472 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>