More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2098 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  44.3 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  42.62 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  43.93 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  44.44 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  44.07 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  44.07 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  49.75 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4078  luciferase family protein  40.78 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  37.31 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  30.85 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  31.01 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  34.81 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  39.81 
 
 		 276 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  39.81 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  33.45 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.17 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  32.41 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  32.41 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  32.41 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  36.61 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  37.32 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  39.46 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  32.49 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  38.6 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  35.71 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  35.68 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  40.61 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  35.36 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  34.91 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  29.09 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  38.46 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.7 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  35.53 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  35.53 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  34.65 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  31.88 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  35.53 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.26 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  30.8 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  35.33 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  30.85 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  32.34 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  31.23 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  31.23 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  30.86 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  34.82 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.31 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  33.6 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  29.79 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  29.79 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  29.79 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  32.48 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  30.93 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  36.7 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.01 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6389  luciferase family protein  33.57 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  39.55 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.24 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  37.84 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.61 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  34.41 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  28.24 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  34.24 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  29.34 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.04 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  35.8 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  30.4 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  31.78 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  30.9 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  31.89 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  32.52 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  30.71 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  32.2 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  34.29 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.38 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  31.58 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.56 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  30.74 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.77 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  29.18 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  33.92 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3246  luciferase family protein  32.32 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.05728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  37.78 
 
 		 289 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  33.47 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  35.36 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  34.13 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  31.42 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  29.34 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>