More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3854 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 
288 aa  587  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  70.24 
 
 
288 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  69.9 
 
 
288 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  69.9 
 
 
292 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  69.9 
 
 
288 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  70.83 
 
 
288 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  70.92 
 
 
284 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  67.35 
 
 
290 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  69.2 
 
 
296 aa  401  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1850  hypothetical protein  67.24 
 
 
290 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  42.91 
 
 
293 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  42.91 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  42.91 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  40.48 
 
 
290 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  42.41 
 
 
290 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  37.63 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  36.43 
 
 
285 aa  168  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.99 
 
 
293 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  36.23 
 
 
295 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  34.15 
 
 
286 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  34.15 
 
 
286 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  34.15 
 
 
286 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.36 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  34.43 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  37.88 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.34 
 
 
293 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  30.74 
 
 
272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  27.74 
 
 
311 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  30.4 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  36.41 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3625  luciferase-like protein  38.61 
 
 
202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  34.17 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.65 
 
 
273 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  33.2 
 
 
293 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  30.1 
 
 
284 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  35.18 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.5 
 
 
283 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  31.86 
 
 
306 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.5 
 
 
283 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.5 
 
 
283 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  33.5 
 
 
291 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  38.02 
 
 
304 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
293 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  30.21 
 
 
337 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  35.26 
 
 
289 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  33.18 
 
 
274 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  34.41 
 
 
278 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  32.47 
 
 
288 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  31.7 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  37.41 
 
 
327 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  38.25 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  33.95 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.94 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  35.64 
 
 
307 aa  95.9  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  37.7 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  31.97 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  33.33 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  33.33 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  31.15 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  35.67 
 
 
278 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  33.33 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  33.33 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  39.16 
 
 
278 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  30.21 
 
 
519 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  31.09 
 
 
299 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  30.98 
 
 
285 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  28.17 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  35.54 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  30.23 
 
 
335 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  30.6 
 
 
335 aa  89  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  40 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  29.83 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  38.13 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  32.61 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  29.67 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  26.24 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  31.86 
 
 
543 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.89 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  36.6 
 
 
308 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  36.6 
 
 
308 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2017  Luciferase-like monooxygenase  33.18 
 
 
330 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00175263  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.92 
 
 
364 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  33.18 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  32 
 
 
282 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  32.22 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  35.95 
 
 
308 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.5 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  31.19 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  32.82 
 
 
764 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  32.97 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  31.13 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  31.29 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  34.16 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  30.15 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  30.15 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
754 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  30.15 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4078  luciferase family protein  29.79 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  30.46 
 
 
775 aa  82.4  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  31.8 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>