More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0272 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 
292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  72.07 
 
 
288 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  71.38 
 
 
288 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  71.38 
 
 
288 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  71.82 
 
 
296 aa  421  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1850  hypothetical protein  70.69 
 
 
290 aa  417  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  69.9 
 
 
288 aa  411  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  71.03 
 
 
288 aa  411  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  69.42 
 
 
290 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  67.61 
 
 
284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  42.56 
 
 
293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  42.56 
 
 
293 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  42.56 
 
 
293 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  38.62 
 
 
290 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  38.83 
 
 
290 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  35.9 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  34.71 
 
 
285 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  35.58 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  33.69 
 
 
286 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  33.69 
 
 
286 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  33.69 
 
 
286 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.85 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  35.37 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 
299 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3625  luciferase-like protein  37.75 
 
 
202 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  30.08 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  35.53 
 
 
293 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  31.28 
 
 
272 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.34 
 
 
305 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  26.96 
 
 
284 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 
286 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  31.91 
 
 
298 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  27.85 
 
 
306 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  29.38 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  33.87 
 
 
289 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  35.59 
 
 
346 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  26.71 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  27.21 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  28.88 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  29.09 
 
 
299 aa  92.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 
291 aa  92  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  28.41 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  28.41 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  30.77 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  28.41 
 
 
351 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  25.61 
 
 
306 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  25.18 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  31.47 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  29.65 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  29.65 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.24 
 
 
273 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  29.65 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  28.35 
 
 
281 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  26.51 
 
 
337 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  28.38 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  31.41 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  30.56 
 
 
324 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  33.92 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  33.92 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  29.26 
 
 
335 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  33.33 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.91 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  34.68 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  34.5 
 
 
288 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  38.58 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  36.69 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  27.59 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  30.7 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  34.75 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.59 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  30.2 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  25.91 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.63 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  38.4 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  29.51 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  29.25 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  29.25 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  28.91 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.23 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  31.98 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  31.07 
 
 
299 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  35.04 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  28.81 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  24.91 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  28.99 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  23.99 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  30.5 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  23.99 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  30.5 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  23.99 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  25.1 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4899  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.03 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  27.83 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  28.34 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  23.91 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>