More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6444 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  100 
 
 
293 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3246  luciferase family protein  54.36 
 
 
292 aa  289  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.05728  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  37.72 
 
 
293 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  37.72 
 
 
293 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  37.13 
 
 
293 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  34.38 
 
 
306 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.19 
 
 
299 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  33.84 
 
 
328 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  29.26 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  25.71 
 
 
337 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.99 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  31.19 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  36.16 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  36.81 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  36.46 
 
 
341 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  33.49 
 
 
322 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  34.13 
 
 
288 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  28.77 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  31.46 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.29 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  35.59 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  30.39 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  38.26 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  33.54 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  33.54 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  33.54 
 
 
288 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  34.81 
 
 
298 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  37.41 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  31.88 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  35.26 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.2 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  31.25 
 
 
339 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  30.51 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  33.5 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  33.68 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.19 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  32.05 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  27.27 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  30.59 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  33.33 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  33.67 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  26.64 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  31.36 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  32.35 
 
 
362 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.4 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  28.57 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  34.64 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  35.51 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  28.57 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  28.57 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  28.48 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  32.81 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  33.33 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  25.63 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  32.23 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  31.79 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  34.54 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  33.33 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  30.58 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  27.91 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  30.93 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  24.85 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  32.65 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0366  hypothetical protein  55.56 
 
 
63 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.599161  normal  0.346783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.3 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  35.26 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  26.98 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.71 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  29.18 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  32.2 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  37.31 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  35.15 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.02 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  30.27 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.85 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  30.85 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.24 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  31.82 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.85 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.25 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  33.13 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  36.11 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1850  hypothetical protein  34.9 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  29.6 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.37 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5777  luciferase family protein  30.39 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  30.59 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  33.89 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  25.26 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  29.48 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  32.92 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  35.42 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  35.42 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.7 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.18 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>