More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4404 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  100 
 
 		 338 aa  702    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  84.08 
 
 		 336 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  79.28 
 
 		 336 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  79.28 
 
 		 336 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  79.58 
 
 		 336 aa  564  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  79.28 
 
 		 336 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  79.58 
 
 		 336 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  76.58 
 
 		 336 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  65.36 
 
 		 337 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  60.54 
 
 		 339 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  56.97 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  54.22 
 
 		 342 aa  358  8e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  51.66 
 
 		 331 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  50.15 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  36.36 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.53 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  34.94 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  35.67 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  34.82 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  33.74 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.91 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  35.26 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  35.33 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  33.83 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.63 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  32.93 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  33.14 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  34.83 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.32 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  37.8 
 
 		 360 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.17 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  33.03 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  32.43 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.74 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  36.25 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  32.13 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 		 322 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  33.13 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  30.97 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.72 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  29.61 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.51 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.14 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  29.82 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  31.4 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  31.25 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  32.05 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  32.11 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  33.54 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  31.56 
 
 		 503 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  32.33 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.65 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  30.91 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  31.09 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  32.65 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  30.68 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  43.18 
 
 		 260 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  32.25 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  32.25 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  32.25 
 
 		 330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.03 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  31.33 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  29.22 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  31.82 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  31 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.31 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  28.66 
 
 		 318 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  31.15 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  30.03 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.33 
 
 		 349 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  25.76 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.09 
 
 		 326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  28.66 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  26.51 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  28.31 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  28.35 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  28.35 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  28.35 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.23 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  28.7 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  27.96 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  27.1 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  31.94 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.72 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  31.12 
 
 		 543 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  30.83 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.11 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.46 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  32.57 
 
 		 371 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.43 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.64 
 
 		 299 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  26.45 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  27.33 
 
 		 338 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.88 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>