More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3680 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  100 
 
 
322 aa  655    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  70.22 
 
 
321 aa  441  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  67.39 
 
 
325 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  62.58 
 
 
321 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  70.16 
 
 
322 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  54.09 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  53.23 
 
 
320 aa  335  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  51.91 
 
 
379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  47.96 
 
 
322 aa  311  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  49.69 
 
 
321 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  45.2 
 
 
328 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  46.46 
 
 
318 aa  277  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  46.56 
 
 
320 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  44.89 
 
 
328 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  45.92 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  45.51 
 
 
330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  45.51 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  45.51 
 
 
330 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  41.9 
 
 
318 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  44.15 
 
 
318 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  45.62 
 
 
503 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  44.85 
 
 
331 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  45.91 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  40.82 
 
 
318 aa  262  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  41.72 
 
 
320 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  40.38 
 
 
330 aa  249  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  50 
 
 
260 aa  245  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  41.23 
 
 
322 aa  242  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  44.41 
 
 
321 aa  238  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  43.08 
 
 
319 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  40.44 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  42.68 
 
 
321 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  41.72 
 
 
321 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  37.54 
 
 
338 aa  220  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  39.26 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  34.15 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  37.54 
 
 
332 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.78 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  33.54 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  36.28 
 
 
329 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  36.14 
 
 
321 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  35.94 
 
 
328 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  35.98 
 
 
332 aa  188  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  34.36 
 
 
329 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  35.15 
 
 
336 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  34.94 
 
 
332 aa  185  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.44 
 
 
333 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  33.33 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  35.31 
 
 
336 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  32.02 
 
 
333 aa  182  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  34.74 
 
 
332 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  33.33 
 
 
336 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  37.11 
 
 
318 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  33.75 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.42 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  33.33 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.83 
 
 
339 aa  179  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  32.74 
 
 
338 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  32.24 
 
 
336 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  32.24 
 
 
336 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  32.24 
 
 
336 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  35.28 
 
 
326 aa  175  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  35.05 
 
 
337 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  34.16 
 
 
325 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  31.95 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.76 
 
 
326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  34.35 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.33 
 
 
321 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  33.23 
 
 
329 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  33.23 
 
 
329 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  33.23 
 
 
329 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.33 
 
 
331 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.05 
 
 
331 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  34.6 
 
 
360 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  35.39 
 
 
343 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.04 
 
 
349 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  36.31 
 
 
323 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  28.35 
 
 
330 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  33.54 
 
 
320 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  32.61 
 
 
321 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  35.5 
 
 
343 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.93 
 
 
342 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  33.86 
 
 
320 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  32.41 
 
 
325 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  32.61 
 
 
320 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.98 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  59.6 
 
 
287 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.94 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  29.28 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  35.03 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  35.68 
 
 
299 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0336  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.12 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.56 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.57 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  33.92 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  39.02 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  36.9 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  32.72 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>