More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5777 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5777  luciferase family protein  100 
 
 
326 aa  634    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  47.81 
 
 
314 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  45.34 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  41.29 
 
 
336 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  28.74 
 
 
353 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  28.81 
 
 
315 aa  119  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  34.75 
 
 
322 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  32.03 
 
 
330 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  28.78 
 
 
334 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  30.67 
 
 
330 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.29 
 
 
328 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.72 
 
 
294 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
328 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  30.2 
 
 
338 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  28.4 
 
 
310 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
327 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  30.79 
 
 
308 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  30.23 
 
 
330 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  30.74 
 
 
327 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  31.9 
 
 
338 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  31.9 
 
 
338 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  31.9 
 
 
338 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  29.18 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  31.39 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  31.61 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  29.9 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  32.48 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.39 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  28.81 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  30.74 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  33.33 
 
 
274 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  32.39 
 
 
299 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  28.1 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  32.77 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  30.48 
 
 
288 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  29.04 
 
 
371 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  38.69 
 
 
278 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  31.67 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  30.26 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  31.63 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.84 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  28.23 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  30.59 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  30.59 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  32.43 
 
 
272 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.03 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  30.84 
 
 
316 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  31.7 
 
 
307 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  23.14 
 
 
368 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  37.64 
 
 
307 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.41 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  30.59 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  29.63 
 
 
341 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  26.35 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.45 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.8 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  29.84 
 
 
309 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  33.49 
 
 
306 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  29.84 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  29.84 
 
 
309 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  28.98 
 
 
364 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  27.33 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.31 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  32.66 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.36 
 
 
273 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  26.32 
 
 
319 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3094  Luciferase-like monooxygenase  33.65 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0527928  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.45 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  33.18 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  29.13 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  33.18 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  34.9 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  33.18 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  28.71 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  30.91 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0594  luciferase-like protein  32.23 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  33.86 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  28.29 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  26.98 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  28.88 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  35.07 
 
 
543 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  28.88 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  26.51 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  29.74 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  36.54 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  27.25 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  25.96 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.18 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  27.24 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  28.52 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  27.86 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  26.24 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0810  luciferase family protein  36.21 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  29.84 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>