More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2560 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  100 
 
 		 305 aa  616  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  87.15 
 
 		 298 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  56.58 
 
 		 288 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  54.77 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  48.75 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  48.39 
 
 		 296 aa  251  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  48.77 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  42.76 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  36.89 
 
 		 272 aa  142  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.38 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  33.73 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  35.59 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  29.41 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.29 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  34.41 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  36.18 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  34.85 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  32.43 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  34.55 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  36.54 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  37.3 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.49 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  32.18 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.86 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  32.08 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  39.23 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  33.33 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  34.5 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  33.33 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  37.5 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  33.16 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  35.29 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  36.96 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  36.96 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  32.61 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  37.63 
 
 		 278 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  32.46 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  37.11 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  36.68 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  35.33 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  29.04 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  31.6 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  39.86 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  32.31 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  33 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  31.4 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  33 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  33 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  33.69 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.34 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  32.81 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  32.64 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  28.63 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  31.37 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  33.01 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  28.3 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  31.75 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  28.3 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  37.42 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  34.53 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  36.97 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  35.78 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  28.3 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.51 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  35.21 
 
 		 284 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 343 aa  99  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  33.16 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  32.06 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  29.31 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  36.3 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  31.13 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  34.17 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  30.11 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  31.51 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  33.67 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  33.67 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  35.48 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  33.67 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.38 
 
 		 314 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  34.59 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 327 aa  95.5  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  35.76 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.96 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  30.13 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.18 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  32.68 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  31.94 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  26.49 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  32.95 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  32.61 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  29.13 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  35.96 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  33.8 
 
 		 342 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  27.4 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>