More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2322 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  100 
 
 
281 aa  552  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  44.78 
 
 
307 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  40.08 
 
 
272 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  40.91 
 
 
306 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  37.41 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  38.06 
 
 
351 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  34.93 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  31.97 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  37.06 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  37.82 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  39.53 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  37.85 
 
 
284 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  34.72 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  40.61 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  39.61 
 
 
293 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  34.47 
 
 
292 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  35.98 
 
 
295 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  37.32 
 
 
274 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  32.7 
 
 
282 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  32.7 
 
 
282 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  32.7 
 
 
282 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  37.89 
 
 
311 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  38.89 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  33.71 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  36.23 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  40.11 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  36.98 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  40.11 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  40.11 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  36 
 
 
288 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  41.34 
 
 
306 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.45 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  42.25 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.18 
 
 
273 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  32.91 
 
 
341 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.08 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  36.32 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  32.33 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  40 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  39.32 
 
 
287 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  39.8 
 
 
274 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
291 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  43.31 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  34.38 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  40.22 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  39.35 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.17 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  32.33 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  39.5 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.36 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  48.55 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  36.97 
 
 
346 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  35.38 
 
 
275 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  35.75 
 
 
289 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  34.5 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  38.07 
 
 
306 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  36.07 
 
 
315 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  39.34 
 
 
286 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  36.12 
 
 
288 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  36.44 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  35.5 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  35.35 
 
 
362 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  38.76 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  34.69 
 
 
283 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  34.69 
 
 
283 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  34.69 
 
 
283 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  37.22 
 
 
341 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  33.33 
 
 
337 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  41.18 
 
 
278 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  47.1 
 
 
308 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  47.1 
 
 
308 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  47.1 
 
 
308 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  31.6 
 
 
278 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  36.46 
 
 
299 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.16 
 
 
288 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  36.54 
 
 
328 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  33.33 
 
 
353 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  29.89 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  29.89 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  35.8 
 
 
306 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  34.5 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  29.52 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  30.53 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  28.77 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  29.58 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.92 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  35.8 
 
 
334 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  32.66 
 
 
293 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  37.89 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  31.11 
 
 
342 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  38.12 
 
 
322 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  30.53 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  35.11 
 
 
312 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  31.7 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  36.65 
 
 
334 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  32.13 
 
 
285 aa  92  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  34.36 
 
 
285 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  35.23 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.55 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  35.23 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>