More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1886 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  100 
 
 		 287 aa  567  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  75.81 
 
 		 292 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  57.4 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  54.18 
 
 		 277 aa  269  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  56.74 
 
 		 274 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  55.25 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  50.74 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  50.78 
 
 		 275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  43.49 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  42.38 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  42.38 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  42.38 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  42.75 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  40.64 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  44.32 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  40.5 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  40.14 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2903  putative F420-dependent oxidoreductase  40.86 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.795057  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12191  hypothetical protein  41.84 
 
 		 288 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.69283e-42  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  38.6 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  37.6 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  37.21 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  36.43 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  34.86 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  39.32 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  31.48 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  34.29 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  36.16 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  36.72 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  36.72 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  36.72 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  37.36 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  35.54 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  37.7 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  30.32 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  33.02 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  32.03 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  38.46 
 
 		 325 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  40.1 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  32.49 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  33.01 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 		 332 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  35.64 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  33.52 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  34.57 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  34.57 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  32.94 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  34.57 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  37.18 
 
 		 324 aa  99  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  38.32 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31 
 
 		 346 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  33.51 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  29.6 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  33.09 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  35.26 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4078  luciferase family protein  36.7 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  35.26 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4930  luciferase-like protein  37 
 
 		 237 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  33.52 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.08 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  35.26 
 
 		 351 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  34.73 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  35.19 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  36.26 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  32.24 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  41.18 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  33.49 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.03 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  38.97 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  34.97 
 
 		 354 aa  92  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  38.97 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  27.36 
 
 		 316 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  38.97 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.37 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  32.03 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.9 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  37.43 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  33.97 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  33.97 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  33.97 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  31.88 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.68 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  34.2 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  32.26 
 
 		 358 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.68 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  36.55 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  35.62 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  34.03 
 
 		 282 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  34.05 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  34.34 
 
 		 358 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  40.69 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  32.46 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  31.02 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  30.59 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  33.51 
 
 		 363 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>