More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4322 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  100 
 
 		 358 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  81.98 
 
 		 354 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  75.42 
 
 		 358 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  73.89 
 
 		 363 aa  587  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  43.35 
 
 		 347 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  44.38 
 
 		 347 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  43.8 
 
 		 347 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  43.23 
 
 		 346 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  43.23 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  43.06 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  42.2 
 
 		 347 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  43.3 
 
 		 355 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  42.65 
 
 		 346 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  43.35 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  42.9 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  42.15 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  42.15 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  41.16 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  44.48 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  38.95 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  37.39 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.62 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.36 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.31 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  30.95 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.89 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.47 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  30.27 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.86 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.52 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  29.38 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  29.94 
 
 		 362 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 		 362 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31.63 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.06 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.98 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.44 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.18 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  28.53 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  26.76 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  34.17 
 
 		 355 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.83 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  36.02 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  25.15 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  26.22 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.53 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  26.88 
 
 		 307 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  24.6 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  36.81 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  34.09 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  32.43 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.81 
 
 		 415 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.96 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  27.02 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  29.25 
 
 		 377 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  36.11 
 
 		 321 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  34.74 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  35.96 
 
 		 439 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  28.94 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  35.86 
 
 		 292 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  25.15 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  28.45 
 
 		 439 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  35.66 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  25.22 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  35.59 
 
 		 436 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  24.28 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  27.24 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  35.59 
 
 		 436 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.27 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  35.59 
 
 		 436 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  25.21 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  34.01 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  30.53 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  25.8 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.26 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  25.59 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  23.78 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  25.24 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  25.85 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  22.16 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 1107 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  26.05 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  24.77 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  31.31 
 
 		 365 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  27.52 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.12 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  27.27 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  22.46 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  34.34 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  26.11 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  26.02 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  26.11 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  27.71 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>