More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2477 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  100 
 
 
344 aa  723    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  63.19 
 
 
345 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  59.42 
 
 
345 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  58.84 
 
 
346 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  59.13 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  58.26 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  58.72 
 
 
343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  53.91 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  46.97 
 
 
347 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  45.69 
 
 
355 aa  341  9e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  46.4 
 
 
346 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  45.98 
 
 
347 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  46.4 
 
 
346 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  45.24 
 
 
347 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  45.82 
 
 
345 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  45.98 
 
 
346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  44.96 
 
 
345 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  41.16 
 
 
354 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  38.26 
 
 
363 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  37.68 
 
 
358 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  37.68 
 
 
358 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.73 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.28 
 
 
376 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 
374 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.24 
 
 
363 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  25.21 
 
 
352 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.6 
 
 
365 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
352 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.34 
 
 
328 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  25.14 
 
 
353 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  25.8 
 
 
334 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  23.15 
 
 
331 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  23.78 
 
 
362 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  26.67 
 
 
355 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  25.38 
 
 
4483 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  26.84 
 
 
341 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  24.5 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  25.54 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  25.54 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  24.18 
 
 
355 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  24.73 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  25.29 
 
 
335 aa  89.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  22.87 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  25 
 
 
380 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  22.32 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  21.89 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  28.14 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  25.15 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  25 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  25.95 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  23.03 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  23.98 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.5 
 
 
329 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  25.93 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.71 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  24.7 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  22.35 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  25.78 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  24.76 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  23.98 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  24.47 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  28.04 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  26.98 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  23.93 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  23.75 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  24.1 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  27.38 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  30.11 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  23.46 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  24.88 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  27.27 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  25.08 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  24.29 
 
 
3337 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  24.72 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  36.26 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  27.2 
 
 
436 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  27.2 
 
 
436 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.86 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  27.2 
 
 
436 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  24.29 
 
 
321 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  24.29 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  25.48 
 
 
1541 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  26.89 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  26.9 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  23.65 
 
 
6889 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  23.75 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  22.42 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  23.75 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  25.45 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  25.33 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>