More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0962 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  100 
 
 		 354 aa  748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  87.25 
 
 		 356 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  63.94 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06241  alkanal monooxygenase beta chain  29.22 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0961  alkanal monooxygenase beta chain  28.41 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3636  alkanal monooxygenase  28.28 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.372909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  26.35 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.47 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.9 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.84 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  29.23 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  29.26 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.98 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.65 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.86 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  25.82 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.3 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.82 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  27.31 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  25.98 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  20.58 
 
 		 353 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  29.03 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  24.83 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  26.05 
 
 		 364 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  29.03 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  29.03 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.96 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  28.8 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  23.1 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  24.78 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  23.77 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  34 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  24.56 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.96 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  22.35 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.54 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  32.24 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  27.81 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  26.74 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  28.1 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  25.34 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  25.08 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  22.29 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  24.02 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  26.07 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  29.73 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.56 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 		 1107 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1971  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.93 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  30.46 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  27.27 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2076  luciferase-like  35.45 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  25.97 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  22.61 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  30.41 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  25.78 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  21.1 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  23.19 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  24.92 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  25.42 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.58 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.44 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25.73 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  23.41 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  26.24 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  23.41 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  22.41 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  22.71 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  23.23 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  23.41 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  33.04 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  22.61 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  35.35 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  24.62 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  22.25 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  24.44 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  21.13 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  29.73 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  25.2 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  22.79 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  23.03 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  22.59 
 
 		 3337 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  24.9 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  23.88 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  24.89 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  32 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  28.48 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.81 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  28.8 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  35.42 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  31.11 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  25.64 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  30.15 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  30.15 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  30.15 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  27.72 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  26.82 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>