More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2849 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  100 
 
 		 341 aa  669    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  49.42 
 
 		 356 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  47.71 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  45.76 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  29.74 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  26.35 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  27.79 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.94 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.09 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0961  alkanal monooxygenase beta chain  24.2 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.23 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  37.23 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06241  alkanal monooxygenase beta chain  26.05 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.47 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  32.95 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.27 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  31.69 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3636  alkanal monooxygenase  23.19 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.372909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  37.91 
 
 		 364 aa  95.9  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  29.64 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.39 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.37 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  32.59 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  26.32 
 
 		 333 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.46 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  34.21 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.45 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  31.2 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  31.47 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  31.37 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1503  luciferase family protein  35.96 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.417579  normal  0.165291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  26.34 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  26.09 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  38.07 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  33.33 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  32.26 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  29.97 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.57 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  31.66 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  26.8 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  35.96 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  28.3 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  29.51 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  33.69 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.15 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  29.74 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  24.51 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  31.52 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  36.59 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.64 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  31.49 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  28.51 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  30.81 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  25.32 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  30.81 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  29.57 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.26 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  29.79 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  32.04 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  25 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  30.85 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  34.68 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  34.32 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  31.55 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  31.49 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  28.31 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1360  luciferase-like protein  33.67 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  30.12 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  27.4 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  42.22 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  31.71 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  29.95 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  29.41 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  28.72 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  33.5 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  33.5 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  26.13 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  24.44 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  28.84 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  24.44 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  24.12 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  34.16 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  24.44 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  33.51 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.48 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  25.08 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0226  luciferase family protein  34.07 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  28.04 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  31.15 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  27.19 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  30.58 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>