More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0226 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0226  luciferase family protein  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  66.99 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  66.99 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  66.51 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  58.88 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  54.72 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  55.71 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  55.19 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  56.19 
 
 		 338 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  48.87 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  48.5 
 
 		 333 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  55.19 
 
 		 338 aa  222  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  51.17 
 
 		 333 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  55.14 
 
 		 340 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  53.99 
 
 		 397 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  55.4 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  51.17 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  56.67 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  55.4 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  51.66 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  54.98 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  53.62 
 
 		 351 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  53.62 
 
 		 351 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  55.87 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  49.03 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  53.99 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  53.99 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  53.99 
 
 		 424 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  53.99 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  53.99 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  53.99 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  47.88 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  54.81 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  52.66 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  53.59 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  48.65 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  53.77 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  53.37 
 
 		 341 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  55.07 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  54.81 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  55.19 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  55.12 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  50 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  56.19 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  53.59 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  51.18 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1360  luciferase-like protein  52.83 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  50.71 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  55.29 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  54.07 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  55.19 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  50.71 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  50.71 
 
 		 335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  50.71 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  46.36 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  50.71 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  53.11 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  50.24 
 
 		 348 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  54.33 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  51.9 
 
 		 339 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  46.48 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  50.94 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  51.43 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  54.93 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  52.13 
 
 		 339 aa  211  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  53.62 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  45.95 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  53.62 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  54.63 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  53.62 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  53.11 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  45.95 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  53.37 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  53.37 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  52.11 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  48.64 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  45.59 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  53.14 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  53.37 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  53.37 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0138  luciferase family oxidoreductase, group 1  54.55 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.402113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  53.62 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  54.98 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  52.83 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  50 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  53.14 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  51.13 
 
 		 327 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  51.17 
 
 		 335 aa  208  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  53.11 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12570  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.08 
 
 		 335 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  51.9 
 
 		 338 aa  208  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  52.66 
 
 		 335 aa  208  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  53.11 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  50 
 
 		 353 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  50.94 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  52.58 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  52.83 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  51.17 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  52.66 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  52.66 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>