More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3153 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  100 
 
 
348 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  67.96 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  64.94 
 
 
346 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  64.72 
 
 
344 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  66.17 
 
 
344 aa  431  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 
345 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  63.86 
 
 
348 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  66.07 
 
 
376 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  57.86 
 
 
343 aa  371  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  59.33 
 
 
341 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.29 
 
 
372 aa  318  9e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  52.57 
 
 
405 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  33.04 
 
 
345 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.41 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.8 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.03 
 
 
329 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.27 
 
 
341 aa  106  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  29.61 
 
 
341 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.03 
 
 
353 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  31.53 
 
 
343 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  31.79 
 
 
359 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  33.33 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  27.99 
 
 
347 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  31.69 
 
 
381 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.27 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  29.32 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  33.91 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  33.87 
 
 
342 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.49 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  29.97 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  27.49 
 
 
346 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.49 
 
 
346 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  30.25 
 
 
361 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  30 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  27.03 
 
 
345 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  31.01 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.94 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  45.95 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  28.77 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.22 
 
 
345 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  30.43 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  34.93 
 
 
362 aa  89.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 
341 aa  89.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  28.85 
 
 
361 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  38.28 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.21 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.38 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  29.91 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  38.28 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  43.81 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.52 
 
 
415 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  30.51 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  28.22 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  30.55 
 
 
329 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  42.34 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  38.57 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.87 
 
 
386 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  28.7 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  42.31 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  42.31 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  29.16 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  39.62 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.97 
 
 
6889 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  29.85 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  27.78 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  26.47 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.52 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  31.82 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  28.85 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  28.15 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  33.87 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  45.05 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.11 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  36.17 
 
 
365 aa  82.4  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  29.01 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  32.58 
 
 
436 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  32.58 
 
 
436 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  32.58 
 
 
436 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  27.59 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  27.32 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  48.91 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  31.11 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  38.05 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  36.97 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  36.75 
 
 
362 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  28.04 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  29.78 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.14 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  48.19 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  26.46 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  28.88 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  34.34 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  27.32 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  24.7 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  29.05 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>