More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3446 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  100 
 
 		 341 aa  687    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  69.73 
 
 		 345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  67.35 
 
 		 344 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  68.53 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  65.19 
 
 		 340 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  65 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  61.18 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  58.82 
 
 		 344 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  58.82 
 
 		 340 aa  411  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  58.53 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  58.82 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  60.29 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  59.12 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  58.82 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  58.24 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  63.61 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  58.53 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  56.03 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  57.35 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  58.24 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  58.06 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  59.41 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  59.71 
 
 		 348 aa  391  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  56.47 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  55.59 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  57.99 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.39 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  51.45 
 
 		 355 aa  323  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  54.58 
 
 		 274 aa  245  8e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  51.94 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  32.38 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  32.76 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  30.77 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  33.14 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  31.65 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  32.21 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  31.52 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  33.73 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  30.99 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  29.97 
 
 		 342 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.71 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  32.85 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  32.07 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  32.77 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  32.54 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  31.58 
 
 		 348 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  32.32 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  31.42 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  31.71 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  29.61 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  62.2 
 
 		 127 aa  99.4  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.24 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  29.52 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.98 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  32.55 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  31.03 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  37.36 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  48.96 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29.36 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  44.09 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  31.38 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  43.01 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  40.35 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  27.83 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  27.83 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  32.2 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.3 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  45.35 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  50 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.07 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  31.56 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  30.32 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  28.5 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  39.58 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  39.13 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  30.03 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  33.77 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.43 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  38.18 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.04 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  28.5 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.14 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  36.96 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  28.19 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  36.96 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  27.24 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  35.06 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  36.96 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  36.96 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  28.74 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  48.1 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  38.04 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.6 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  29.44 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>