More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2676 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
340 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  95.29 
 
 
340 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  87.06 
 
 
341 aa  617  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  86.76 
 
 
344 aa  617  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  85.88 
 
 
341 aa  611  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  89.41 
 
 
348 aa  610  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  85.88 
 
 
340 aa  608  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  85 
 
 
340 aa  603  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  84.41 
 
 
340 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  85.29 
 
 
340 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  84.41 
 
 
338 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  82.65 
 
 
340 aa  591  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  79.41 
 
 
340 aa  567  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  80.59 
 
 
344 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  74.12 
 
 
340 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  75.22 
 
 
340 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  72.65 
 
 
340 aa  531  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  74.41 
 
 
340 aa  528  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  74.56 
 
 
338 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  73.53 
 
 
338 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  74.71 
 
 
341 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.71 
 
 
340 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  61 
 
 
344 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  60.95 
 
 
345 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  58.82 
 
 
341 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  59.94 
 
 
361 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  54.81 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  48.26 
 
 
355 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.29 
 
 
274 aa  247  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  48.06 
 
 
258 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  32.19 
 
 
350 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  32.62 
 
 
361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.26 
 
 
365 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  29.83 
 
 
359 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
372 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 
341 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 
346 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  29.47 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  29.83 
 
 
344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  28.61 
 
 
338 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  31.07 
 
 
381 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  27.41 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  27.41 
 
 
337 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  30.23 
 
 
331 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  27.71 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.87 
 
 
347 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.53 
 
 
348 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.44 
 
 
127 aa  89.4  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  29.79 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.06 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.76 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  31.13 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  28.44 
 
 
405 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  28.79 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  28.33 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.69 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.07 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  29.41 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  26.39 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.65 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  28.52 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  28.42 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  27.23 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.34 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  36.46 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  47.14 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  38.3 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  30.43 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.71 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  38.1 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  37.14 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  40 
 
 
323 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.41 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  37.35 
 
 
352 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  35.09 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  41.25 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  29.58 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.96 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.83 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  40 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.24 
 
 
371 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  42.86 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  30.82 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  25 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  43.04 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  34.07 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  32.52 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.19 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  35.71 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  26.83 
 
 
334 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.03 
 
 
380 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  25.14 
 
 
377 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  32.52 
 
 
334 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>