More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06242 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  100 
 
 		 355 aa  748    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  63.94 
 
 		 354 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  64.87 
 
 		 356 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  29.74 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06241  alkanal monooxygenase beta chain  30.2 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0961  alkanal monooxygenase beta chain  29.73 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3636  alkanal monooxygenase  30.82 
 
 		 326 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.372909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.87 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  28.33 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.43 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.45 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.41 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.32 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  28.53 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  26.3 
 
 		 352 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  23.53 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.79 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.27 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  23.17 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  24.58 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  23.85 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  24.64 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  24.84 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  23.06 
 
 		 377 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  32.14 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  25 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  23.96 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  24 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  24.59 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 379 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  24.03 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  24.15 
 
 		 355 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  23.14 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  27.3 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  26.38 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29.02 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  24.86 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  22.75 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  27.65 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  21.84 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  21.84 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  25.23 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  24.59 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  24.31 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  23.48 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  22.37 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  21.98 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  23.53 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  22.87 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  24.87 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  23.63 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  23.35 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  27.48 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.09 
 
 		 1107 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  24.03 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  23.98 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  25 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  22.93 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  28.07 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  27.19 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  23.46 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  24.15 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  23.14 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  24.78 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  23.22 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  32.32 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  21.73 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.36 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.64 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  25.78 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  18.77 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  22.11 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  27.68 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  20.22 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  27.13 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  23.48 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  25 
 
 		 3337 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  35.64 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  23.34 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  28.5 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  35.64 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2076  luciferase-like  39.05 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  32.5 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  21.56 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  27.22 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  22.77 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28.27 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1971  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.6 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  27 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  26.53 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  22.57 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  26.53 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  24.4 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  23.23 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  23.17 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>