More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3354 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  100 
 
 		 383 aa  796    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  78.02 
 
 		 387 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  71.31 
 
 		 377 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  63.87 
 
 		 379 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  62.83 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  34.3 
 
 		 415 aa  219  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.23 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.23 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.23 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  30.97 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  30.71 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  30 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  28.53 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  28.72 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.76 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.2 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  29.3 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  29.3 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  30.59 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  35.02 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  30.88 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  30.88 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.76 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  27.13 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  29.68 
 
 		 375 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  35.57 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  26.96 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.03 
 
 		 347 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.96 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  27.49 
 
 		 345 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.88 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  33.17 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  24.34 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  36.57 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  33.85 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  31.53 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  24.04 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.72 
 
 		 341 aa  99.8  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.29 
 
 		 330 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.33 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.96 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  29.08 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.73 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  24.39 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  24.34 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  28.97 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  35.8 
 
 		 327 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24.37 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  24.48 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  29.66 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  27.09 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  35.12 
 
 		 343 aa  96.3  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  25.99 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  25.2 
 
 		 346 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  28.69 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.91 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  25.94 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  25 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  24.37 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  24.34 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.83 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.45 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  26.38 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  35.38 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.14 
 
 		 333 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  39.83 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  39.82 
 
 		 341 aa  90.5  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.49 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.69 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  28.88 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  25.98 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  25.71 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  27.89 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  25.95 
 
 		 356 aa  86.3  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.86 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  35.2 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  31.2 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  29.95 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  28.8 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  25.47 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  27.1 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.91 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  31.95 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  34.78 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  36.76 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  28.5 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  26.91 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  29.91 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  29.71 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  30.7 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  29.71 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  26.89 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  41.84 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>