More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0953 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
348 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  48.04 
 
 
371 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  38.67 
 
 
362 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  38.37 
 
 
364 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  35.29 
 
 
353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 
364 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  25.77 
 
 
362 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.95 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.88 
 
 
352 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  25.98 
 
 
354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  26.59 
 
 
353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.92 
 
 
362 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  28.61 
 
 
362 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
362 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.17 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.88 
 
 
374 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  25 
 
 
356 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  26.27 
 
 
376 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  36.56 
 
 
327 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  30.69 
 
 
341 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  31.77 
 
 
439 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.74 
 
 
342 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.7 
 
 
329 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.05 
 
 
436 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.05 
 
 
436 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.05 
 
 
436 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  31.63 
 
 
382 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  28 
 
 
354 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.84 
 
 
331 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  31.25 
 
 
439 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  26.22 
 
 
358 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  25.65 
 
 
358 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  26.51 
 
 
363 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  26.48 
 
 
333 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.36 
 
 
347 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  26 
 
 
377 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.53 
 
 
347 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  25.94 
 
 
372 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.14 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  33.96 
 
 
363 aa  99.4  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  26.71 
 
 
415 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
343 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.19 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30.91 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  27.54 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.33 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  25.84 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  25.53 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  28.97 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  26.61 
 
 
355 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  34.29 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  23.15 
 
 
352 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  26.57 
 
 
334 aa  95.9  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  25.73 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  24.33 
 
 
351 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.18 
 
 
329 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.51 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  24.4 
 
 
351 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  24.63 
 
 
352 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.43 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.9 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  24.4 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  24.25 
 
 
351 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  26.65 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  24.33 
 
 
351 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  24.33 
 
 
351 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  25.98 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  24.61 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  26.97 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  27.41 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  25.52 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  23.08 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  24 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  23.44 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  38.05 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  25.36 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  25.49 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  24.4 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  35.98 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  33.13 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  24.14 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  22.99 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  28.8 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  27.47 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  37.12 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  50.63 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  37.12 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  33.07 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  50.63 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  32.76 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  27.78 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00310  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.84 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  23.3 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  24.77 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  29.03 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  28.57 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  25.53 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  22.51 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>