More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7675 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  100 
 
 
413 aa  851    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  46.52 
 
 
405 aa  338  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  41.75 
 
 
388 aa  312  9e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  42.42 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  44.67 
 
 
389 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  45.56 
 
 
391 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  43.19 
 
 
396 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  42.42 
 
 
395 aa  279  8e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  42.67 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  42.67 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  31.04 
 
 
366 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  30.85 
 
 
369 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  30.14 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  29.95 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.85 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  27.2 
 
 
368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.87 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  36.67 
 
 
334 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.78 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  27.67 
 
 
362 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  35.67 
 
 
365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  34.3 
 
 
364 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25.69 
 
 
374 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  25.75 
 
 
366 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  34.05 
 
 
436 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  34.05 
 
 
436 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  34.05 
 
 
436 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  33.51 
 
 
439 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  28.86 
 
 
327 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  27.17 
 
 
439 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.92 
 
 
328 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  40.44 
 
 
360 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.69 
 
 
355 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  28.69 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.63 
 
 
333 aa  94  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
379 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
352 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  23.92 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  27.67 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  29.35 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  28.77 
 
 
372 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  28.77 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  25.94 
 
 
352 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  22.67 
 
 
371 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  22.83 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.93 
 
 
343 aa  87.8  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  23.67 
 
 
333 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  23.84 
 
 
352 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  24.66 
 
 
374 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  39.42 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0082  luciferase family protein  34.86 
 
 
296 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.035271 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  29.38 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  24.26 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.59 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.02 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  25.95 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
336 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.64 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.64 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  25.38 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.4 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  25.07 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.03 
 
 
322 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  30.05 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  27.85 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  31.03 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  29.89 
 
 
374 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  25.6 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  24.44 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  30.43 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  23.91 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  29.68 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.81 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  30.23 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  29.11 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  38.6 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  26.86 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  38.6 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  26.29 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  24 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.54 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.27 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  34.78 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  24.24 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 
293 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  21.13 
 
 
354 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  36.11 
 
 
339 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.34 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  28.57 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  26.94 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  32.45 
 
 
282 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.01 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.01 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  30.86 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  35.83 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  24.41 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  37.25 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>