More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0220 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  100 
 
 		 360 aa  750    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  62.04 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  54.67 
 
 		 365 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  41.81 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  35.65 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  35.8 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  31.96 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  30.38 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  30.77 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  30 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  30 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  27.46 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  26.05 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  35.42 
 
 		 389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  27.68 
 
 		 405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  25.48 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  27.54 
 
 		 387 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  25.73 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  25.96 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.18 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  40.44 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  28.19 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.92 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  28.77 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.19 
 
 		 352 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  25.47 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  36.15 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  36.97 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28.77 
 
 		 439 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  26.96 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.22 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  27.36 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  27.36 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  27.36 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  27.75 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  24.62 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  26.54 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  31.46 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  29.69 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  23.32 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  30.6 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  24.78 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  28.03 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  25.1 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  27.37 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  25.33 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  26.81 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  26.4 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  28 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  32.24 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.27 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  27.27 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  30.83 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  33.14 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  29.44 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.14 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  31.17 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  27.05 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.49 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  31.69 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  29.17 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.35 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.95 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  31.93 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06241  alkanal monooxygenase beta chain  32.2 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  26.95 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  25.33 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  23.78 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  28.27 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  30.77 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  28.19 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.07 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  30.28 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  27.62 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  27.62 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  32.14 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  20.72 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  25.2 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  26.48 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.54 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  30.46 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  23.96 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  22.49 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  25.13 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  29.05 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  33.08 
 
 		 275 aa  67  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  22.99 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  30.77 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.55 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  23.34 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  24.44 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  26.78 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  25 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  25.2 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>