More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1444 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  100 
 
 		 438 aa  912    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  47.22 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1184  flavin-dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117407  normal  0.0884697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.89 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.77 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  25.54 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  30.92 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  28.25 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  30.92 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  29.39 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  29.39 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  29.39 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  26.59 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 321 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  34.16 
 
 		 321 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.32 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  38.12 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  27.25 
 
 		 369 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  38.73 
 
 		 346 aa  87.8  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  33.75 
 
 		 341 aa  86.7  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  24.25 
 
 		 324 aa  86.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  26.63 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.58 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.63 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  32.6 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  33.74 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  21.05 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  32.97 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  26.46 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.74 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  28.35 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.7 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  25.27 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  32.29 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  28.9 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  33.17 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  25.28 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  27.91 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  36.99 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  24.15 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.11 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.44 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  32.32 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.24 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  23.74 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  23.65 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  23.65 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.14 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.33 
 
 		 342 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  23.58 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  23.65 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  24.05 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  24.29 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  23.28 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  26.23 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  25.34 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.76 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  25.4 
 
 		 333 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  25.75 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  34.88 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  24.18 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  29.23 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  25.4 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  23.65 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  33.12 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  30.82 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  22.81 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  30.34 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  25.21 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  24.68 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  29.96 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  30.3 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.34 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  37.04 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  25.4 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  22.81 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  28.78 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  23.82 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  33.11 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  31.16 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  22.19 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  25 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  25 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  25 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  40.59 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  29.68 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  24.49 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  31.58 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  28.1 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  31.79 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  25.2 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  25 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>