More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6510 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  96.88 
 
 		 384 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  100 
 
 		 384 aa  801    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  96.88 
 
 		 384 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  30.03 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  29.97 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  29.97 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  29.97 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  29.86 
 
 		 439 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  29.81 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  30.59 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  29.55 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.34 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.64 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.64 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  27.78 
 
 		 377 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.65 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  26.04 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  26.15 
 
 		 415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  25.82 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.33 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  30.57 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.41 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  28.61 
 
 		 734 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  27.38 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  28.78 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  25.62 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  27.38 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.47 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.8 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.28 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.48 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.86 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  26.48 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  27.17 
 
 		 355 aa  93.6  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  25.99 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  25.76 
 
 		 380 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  26.44 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  21.86 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  26.15 
 
 		 340 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  24.56 
 
 		 421 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.65 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  27.62 
 
 		 349 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  27.71 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  25.65 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.32 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.35 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  27.94 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  24.59 
 
 		 346 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  24.7 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  25.73 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  24.86 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  25.82 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  28.28 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  26.02 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  23.66 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  23.6 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25.11 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  24.33 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  24.25 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.22 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  24.8 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  24.1 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  24.78 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.23 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  24.42 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  24.78 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.88 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  26.19 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.73 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  26.87 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.2 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  23.43 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  25.57 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  23.71 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  24.56 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  32.11 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  24.56 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  24.38 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  24.38 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  24.38 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  24.41 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  26.48 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  26.48 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  25.07 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  25.73 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  25.36 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  23.3 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  23.28 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  26.24 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  23.42 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  24.93 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  24.33 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.47 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>