More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8768 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
375 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  49.73 
 
 
372 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  35.9 
 
 
415 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  32.65 
 
 
436 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  32.65 
 
 
436 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  32.65 
 
 
436 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  32.65 
 
 
439 aa  179  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  32.22 
 
 
439 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
379 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  31.98 
 
 
377 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  34.7 
 
 
402 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  28.39 
 
 
387 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  29.18 
 
 
383 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 
386 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  30.35 
 
 
382 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.2 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.78 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  26.68 
 
 
362 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  26.68 
 
 
362 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  34.63 
 
 
355 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.25 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  29.62 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  29.21 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.61 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  28.61 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.11 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  29.59 
 
 
346 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  29.62 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  29.32 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  29.08 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  29.32 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  28.53 
 
 
345 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.53 
 
 
347 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  26.22 
 
 
389 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  26.72 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  26.72 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.02 
 
 
363 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  27.06 
 
 
384 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  24.46 
 
 
405 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  29.2 
 
 
346 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.84 
 
 
380 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  36.63 
 
 
376 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.59 
 
 
331 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
355 aa  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  27.09 
 
 
346 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  31.4 
 
 
374 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  29.82 
 
 
352 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.88 
 
 
371 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  30.69 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.43 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.62 
 
 
329 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  28.86 
 
 
364 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  31.27 
 
 
345 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  25.07 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
348 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.08 
 
 
311 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  25.08 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  33.33 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  30.89 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  29.71 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.85 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  29.38 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  24.02 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29.15 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  28.33 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  32.55 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  31.79 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  29.14 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  27.4 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  29.09 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  31.12 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  27.41 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  26.94 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  27.9 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  26.11 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  29.67 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  26.2 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  32.64 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  28.14 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  24.55 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  33.7 
 
 
334 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  33.15 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  29.96 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  26.03 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  32.99 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  28.62 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  23.82 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  28.62 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  30.51 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.79 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  32.46 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  35.4 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  26.32 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  28.25 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  30.88 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  28.36 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  26.62 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>