More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6087 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  100 
 
 		 345 aa  719    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  81.5 
 
 		 346 aa  604  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  81.79 
 
 		 346 aa  597  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  80.64 
 
 		 346 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  70.35 
 
 		 345 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  63.37 
 
 		 343 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  58.67 
 
 		 347 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  59.42 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  48.56 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  47.69 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  48.84 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  49.28 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  47.98 
 
 		 347 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  48.7 
 
 		 346 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  48.27 
 
 		 346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  46.38 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  46.09 
 
 		 345 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  41.57 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  41.16 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  39.6 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  41.16 
 
 		 358 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.04 
 
 		 363 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.73 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  35.03 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.68 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.62 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.5 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.94 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  27.25 
 
 		 4483 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  26.86 
 
 		 376 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  24.64 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  24.14 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.84 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.05 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  30.16 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  28.06 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  27.13 
 
 		 1519 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.14 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  24.43 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  25.71 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  26.91 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.18 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  23.89 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  23.9 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.07 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  22.92 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  24.14 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  26.3 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  26.41 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  26.01 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  25.77 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.1 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  28.26 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  32.66 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  25.89 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.42 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.22 
 
 		 1107 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  24.15 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  27.06 
 
 		 1541 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  23.03 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.27 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  25.22 
 
 		 6889 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  23.84 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.38 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  25.07 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  25.89 
 
 		 3337 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  23.64 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  25.44 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  22.29 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  25.07 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  25.07 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  25.07 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  24.8 
 
 		 439 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  30.32 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  28.02 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  23.74 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  23 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  29.68 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  22.51 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  32.5 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  22.84 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  30.71 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  26.48 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  21.31 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  21.56 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.82 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  27 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  27.33 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  25.15 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  29.89 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  22.94 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  26.52 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>