More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1424 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
377 aa  785    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
1107 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 
408 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  33.62 
 
 
1519 aa  201  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  31.32 
 
 
355 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  32.88 
 
 
1541 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  31.52 
 
 
4483 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.43 
 
 
6889 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  30.79 
 
 
3337 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4910  Luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 
372 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.56 
 
 
334 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25 
 
 
341 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  26.17 
 
 
334 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  25.29 
 
 
353 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.86 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.2 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  28.51 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 
374 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.73 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  27.07 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  27.07 
 
 
344 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  29.53 
 
 
333 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  27.07 
 
 
346 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  30.66 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  28.44 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  25.97 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  29.28 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  29.9 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  27.44 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  29.2 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  29.87 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  24.46 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  25.69 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  27.07 
 
 
348 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  28 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.17 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.93 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  29.09 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.16 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  32.91 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  27.23 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  26.27 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  26.5 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  25.97 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  26.91 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  26.73 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  27.6 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  27.44 
 
 
734 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  26.86 
 
 
288 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  30.26 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  25.94 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.68 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  26.79 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  27.07 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  23.18 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  28.05 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  32.43 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  26.83 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  26.83 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  26.83 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  28.19 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.17 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.86 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  28.87 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.08 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  27.71 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  25.54 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  24.03 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  25.54 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  25.54 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  26.09 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  24.61 
 
 
346 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0532  luciferase-like protein  29.34 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  28.15 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  26.22 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  27.69 
 
 
283 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  26.85 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  24.43 
 
 
295 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  27.69 
 
 
283 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  35.78 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  27.69 
 
 
283 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  26.61 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  26.47 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.05 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  29.53 
 
 
278 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  34.19 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  22.62 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  25.3 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  26.35 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  33.33 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  33.66 
 
 
295 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  25.33 
 
 
345 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  33.66 
 
 
296 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
336 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  26.63 
 
 
352 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  27.4 
 
 
384 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>