More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4850 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  68.31 
 
 		 348 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  67.96 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  66.18 
 
 		 346 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  65.53 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  64.55 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  63.5 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  63.2 
 
 		 344 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  60.12 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  55.82 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.68 
 
 		 372 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  51.66 
 
 		 405 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  33.24 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  32.07 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.62 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  31.78 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  32.03 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  31.1 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  30.05 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  30.41 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  32.01 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  30.87 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  31.64 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.43 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  32.21 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  31.8 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  31.08 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  29.23 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  28.96 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  31.34 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  30.19 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  29.84 
 
 		 329 aa  99.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 		 340 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  29.36 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  29.97 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  31.4 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25.08 
 
 		 341 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  32.19 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  29.89 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  32.88 
 
 		 348 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.11 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  30.4 
 
 		 361 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.88 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  29.47 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  39.5 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  38.35 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.02 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.39 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  36.72 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  41.88 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  42.15 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  30.25 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  30.7 
 
 		 361 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  24.79 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  27.22 
 
 		 355 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  32.27 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  31.58 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  38.84 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.7 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  38.84 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.65 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  35.46 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.63 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  37.19 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.57 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  29.49 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  24.86 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  35.46 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  30.03 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  26.49 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  31.09 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.83 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  29.61 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  34.03 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.54 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  37.31 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  28.2 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  41.24 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  30.06 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.67 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  38.46 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  38.46 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  27.64 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.52 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  37.9 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.99 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  32.23 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.26 
 
 		 6889 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  35.54 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  34.31 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>