More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0326 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  100 
 
 		 344 aa  701    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  80.59 
 
 		 344 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  81.47 
 
 		 340 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  81.18 
 
 		 340 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  81.18 
 
 		 340 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  80.29 
 
 		 338 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  80.59 
 
 		 340 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  78.53 
 
 		 340 aa  561  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  79.71 
 
 		 340 aa  560  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  78.53 
 
 		 340 aa  558  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  81.18 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  76.76 
 
 		 340 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  76.47 
 
 		 341 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  76.18 
 
 		 341 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  75.81 
 
 		 340 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  75.67 
 
 		 338 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  73.53 
 
 		 340 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  73.24 
 
 		 340 aa  524  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  74.12 
 
 		 340 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  72.57 
 
 		 338 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  73.75 
 
 		 341 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  71.51 
 
 		 340 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  61.4 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  59.94 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  58.53 
 
 		 341 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  59.24 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.73 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  45.93 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.26 
 
 		 274 aa  257  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  47.08 
 
 		 258 aa  208  9e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  31.41 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  34.45 
 
 		 361 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.88 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  31.99 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  32.2 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  31.09 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  29.11 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  34.77 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  29.46 
 
 		 344 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  28.49 
 
 		 338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  34.75 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  29.21 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  31.14 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  31.78 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  28.57 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.7 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.57 
 
 		 127 aa  92.8  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  29.08 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  26.54 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  32.28 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.85 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.69 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.86 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  31.06 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  30.87 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  35.19 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  28.76 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  28.76 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  25.97 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  28.31 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  26.06 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  25.64 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.69 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  37.61 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  37.5 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  37.37 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  34.73 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  30.77 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  38.1 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  26.48 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  24.08 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  25.44 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.05 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  36.13 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  46.27 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  30.05 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  30.83 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  30.05 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  25 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  35.79 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  29.57 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  25.88 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.52 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  31.78 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  29.92 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  40 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.61 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.29 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  36.14 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  30.47 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>