More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5180 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  100 
 
 		 361 aa  728    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  49.04 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  35.85 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  34.13 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.95 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  34.45 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  34.42 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  33.53 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  33.54 
 
 		 340 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  33.23 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  32.39 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  32.23 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  32.01 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  34.15 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.93 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  32.01 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  34.45 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  33.84 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  31.33 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  31.64 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  31.23 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  30.77 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  31.34 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  33.81 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  32.93 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  32.23 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  32.12 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  33.23 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  32.32 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  31.53 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  30.21 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  32.39 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  30.77 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  27.96 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  31.44 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  30.61 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  31.55 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  31.01 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.77 
 
 		 274 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 		 345 aa  96.3  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.4 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  30.09 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  28.93 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  29.43 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  32.84 
 
 		 258 aa  90.5  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.85 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  27.57 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  29.68 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.29 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  31.88 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  38.52 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.79 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  39.77 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  35.78 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  27.06 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  27.43 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  34.62 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  37.84 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  32.28 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  32.28 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.76 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  32.6 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  27.58 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  32.43 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  39.08 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  34.91 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  26.8 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  31.18 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  31.19 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  26.52 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  29.56 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  35.42 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  36.9 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  40 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.53 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  36.78 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  31.58 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  26.09 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.89 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  24.92 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  37.21 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  36.84 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  25.42 
 
 		 734 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  34.38 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  35.37 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  32.11 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.72 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  27.4 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  24.68 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  24.74 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31.43 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  35.9 
 
 		 334 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>