More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0448 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  100 
 
 		 340 aa  691    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  81.66 
 
 		 338 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  78.47 
 
 		 344 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  76.99 
 
 		 340 aa  539  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  75.81 
 
 		 344 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  75.22 
 
 		 340 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  75.81 
 
 		 340 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  76.11 
 
 		 340 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  76.11 
 
 		 340 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  74.93 
 
 		 340 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  75.22 
 
 		 338 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  74.93 
 
 		 340 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  76.4 
 
 		 348 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  73.75 
 
 		 341 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  73.89 
 
 		 338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  72.86 
 
 		 341 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  75.3 
 
 		 340 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  73.45 
 
 		 340 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  72.73 
 
 		 341 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  67.85 
 
 		 340 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  67.85 
 
 		 340 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  66.96 
 
 		 340 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  66.96 
 
 		 345 aa  461  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  65.19 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  65.59 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.06 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.32 
 
 		 274 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  47.86 
 
 		 258 aa  216  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 372 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  30.19 
 
 		 341 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.92 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  32.54 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  30.21 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  28.41 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  28.41 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  30.36 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  29.8 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  35.04 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  29.53 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  30.14 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  31.06 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.41 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.61 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  27.27 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  57.32 
 
 		 127 aa  96.7  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  28.41 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.75 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  28.88 
 
 		 405 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  27.71 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.91 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  26.46 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  40.37 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  25.93 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  26.52 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.18 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  37.04 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  28.34 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  45.65 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.08 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  28.34 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  26.36 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  28.28 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.78 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  39.58 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  34.59 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  32.67 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.16 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  31.66 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  32.19 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  38.66 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  24.5 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  28.52 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  37.36 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  25.49 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  38.55 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  37.89 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  35.66 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  23.71 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  30 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  25.69 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  26.27 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.78 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  25.72 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  31.78 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  25.91 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  37.65 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  30.72 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.79 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  30.04 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  30.72 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.51 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>