More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3764 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  100 
 
 		 381 aa  750    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  49.31 
 
 		 361 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  36.73 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  36.48 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  34.08 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  35.46 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  35.84 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.63 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  34.02 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  32.16 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  33.73 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  34.52 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  33.04 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  33.04 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  32.45 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  31.25 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  34.32 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  36.01 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.55 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  32.66 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  31.55 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  31.25 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  30.95 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  30.38 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  32.17 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  31.78 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  30.97 
 
 		 344 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  31.66 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  34.92 
 
 		 331 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  31.63 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  30.77 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  30.09 
 
 		 340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  29.68 
 
 		 340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  30.14 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  30.36 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.49 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  31.85 
 
 		 348 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  29.76 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  28.48 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  34.26 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  33.61 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  33.81 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  34.35 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  33.04 
 
 		 344 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  32.01 
 
 		 348 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.98 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  32.75 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  32.27 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  32.27 
 
 		 348 aa  99.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  32.08 
 
 		 376 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.69 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  31 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  34.67 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 343 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  33.99 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  28.08 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  35.03 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  41.11 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.19 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  40 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.67 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  28.25 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  31.03 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  30.46 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  40 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  32.67 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  31.39 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  27.37 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.98 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  33.12 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  41.05 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  32.32 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  33.01 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  34.75 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  31.47 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  30.18 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  29.59 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.82 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  38.14 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  38.18 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  34.11 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  36.21 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  32.7 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.92 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.91 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  29.79 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  40.7 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  41.57 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  28.36 
 
 		 734 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  29.79 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  29.79 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  32.7 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>