More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3415 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  100 
 
 		 337 aa  668    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  74.26 
 
 		 338 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  72.27 
 
 		 341 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  70.88 
 
 		 341 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  68.41 
 
 		 350 aa  454  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  60.83 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  46.27 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  46.18 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  43.99 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  42.77 
 
 		 346 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  45.45 
 
 		 342 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  45.37 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  43.17 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  32.12 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  30.41 
 
 		 345 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  29.91 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  30.99 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.67 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  31.59 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.46 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  28.45 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  27.32 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  34.75 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  35.04 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  35.44 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.45 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  28.57 
 
 		 361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  27.07 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  25.71 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  27.41 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  34.87 
 
 		 340 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  26.4 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  33.19 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  33.19 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  31.65 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  31.36 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  30.51 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  32.77 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  31.44 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  31.06 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  25.66 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  30.93 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  30.61 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  30.72 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.91 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  26.89 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  34.69 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.36 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  27.81 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.57 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  28.74 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  36.67 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  27.94 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.5 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  31.66 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  32.53 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  42.86 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  27.69 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  34.13 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  28.12 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  31.5 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.5 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  39.58 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  30.14 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  42.45 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  43.68 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  30.58 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  44.19 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  44.19 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  35.06 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  34.27 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.62 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  43.9 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.92 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.88 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  26.32 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  35.34 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.61 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  40 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  26.94 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  33.01 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  37.63 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  34.29 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  24.64 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  34.01 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  27.4 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.2 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  34.95 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  51.39 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  45.35 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  32.97 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  50 
 
 		 734 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  27.88 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  45.35 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  29.25 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>