More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2792 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  100 
 
 		 338 aa  681    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  67.36 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  62.91 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  60.83 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  61.95 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  58.6 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  43.84 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  44.71 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  42.42 
 
 		 346 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  44.44 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  41.74 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  43.71 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  43.34 
 
 		 331 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  32.21 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  29.34 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  32.39 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  31.03 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  30.88 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  31.78 
 
 		 381 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.75 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  29.21 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  29.43 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  28.32 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  29.53 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  30.75 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  29.06 
 
 		 344 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.38 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  27.71 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  28 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  28.94 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  28.9 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  34.01 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  28.45 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  28.17 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  26.86 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  28 
 
 		 340 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  27.48 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  26.29 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  29.05 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.37 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  28.08 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  31.7 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  32.08 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  31.41 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.83 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  29.91 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  38.76 
 
 		 405 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  30.58 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  30 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  26.3 
 
 		 355 aa  89.7  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  31.09 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  40.49 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  31.48 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.59 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  36.31 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.41 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  28.21 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  42.57 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  38.52 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  30.21 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  41.82 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  44.71 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  40 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  30.4 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  27.04 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  41.24 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.37 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  37.74 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  39.18 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  45.92 
 
 		 734 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.93 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  43.33 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  37.74 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  33.73 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  31.02 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  37.25 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  24.78 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  42.86 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  31.19 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  32.43 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  40.4 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  42.71 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  30.81 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  37.27 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  43.02 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  29.24 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.53 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  28.57 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  42.31 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  36.54 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  42.31 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  41.18 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  36.97 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  51.95 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  43.04 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>