More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1492 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 
345 aa  687    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  69.41 
 
 
344 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  69.73 
 
 
341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  68.75 
 
 
338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  66.96 
 
 
340 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  69.12 
 
 
361 aa  454  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  61.83 
 
 
344 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  61.18 
 
 
341 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  61.24 
 
 
340 aa  418  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  60.95 
 
 
340 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  61.31 
 
 
338 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  59.94 
 
 
344 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  59.76 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  60.06 
 
 
340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  59.47 
 
 
340 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  60.06 
 
 
341 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  60.06 
 
 
341 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  58.88 
 
 
340 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  62.5 
 
 
340 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  61.95 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  58.88 
 
 
338 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  58.58 
 
 
340 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  57.1 
 
 
340 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  59.29 
 
 
340 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  57.1 
 
 
340 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  56.51 
 
 
340 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  57.39 
 
 
354 aa  378  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  53.2 
 
 
355 aa  325  9e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.87 
 
 
274 aa  272  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  50.58 
 
 
258 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  32.75 
 
 
341 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 
350 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.56 
 
 
365 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  32.39 
 
 
361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  32.83 
 
 
346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  32.56 
 
 
359 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  35.84 
 
 
381 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  32.15 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  30.03 
 
 
341 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  30.03 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  30.41 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  31.03 
 
 
338 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  33.24 
 
 
347 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  31.2 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  32.12 
 
 
341 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  33.04 
 
 
348 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  32.28 
 
 
331 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  62.2 
 
 
127 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  32.63 
 
 
344 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  31.23 
 
 
346 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  32.04 
 
 
344 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  30.61 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  31.06 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  30.7 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  31.09 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  32.19 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  29.36 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.58 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  35.16 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.74 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.96 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  26.36 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  44.68 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  49.37 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  42.35 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  38.46 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  27.27 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.95 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  24.35 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  39.56 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  34.08 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  30.74 
 
 
334 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  32.97 
 
 
328 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  41.46 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  32.28 
 
 
391 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  34.43 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  33.19 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  29.73 
 
 
333 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  41.67 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.33 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  39.62 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  23.46 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  22.73 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  27.7 
 
 
734 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  33.33 
 
 
362 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
362 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  38.1 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  38.1 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  25.62 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  38.1 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  25.81 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  33.04 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  38.1 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  25.37 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  38.33 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  26.69 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  27.36 
 
 
372 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>